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Newick est le nom d'un format de fichier utilisé en biologie pour décrire les relations phylogénétiques entre diverses êtres vivants ou molécules biologiques telles que l'ADN. le code présenté est une classe qui parse une représentation textuelle (sauce moi-même) et généère un arbre à tableau. Avec une 2e passe sur l'arbre on peut reformater les arbres sur d'autres formats dont de l'xml simple.

http://fr.wikipedia.org/wiki/Newick
http://en.wikipedia.org/wiki/Newick_format

// il y a un peu de code de DEMO au debut code:
$toto = '((((1:0.a1,2:a2)3:0.a3,((4:0.b1,5:0.b2)6:0.b3,(7:0.c1,8:0.c2)9:0.c3)10:0.bc3)11:0.abc3,(12:0.d1,13:0.d2):0.d3)14:0.abcd3,15:0.e2)';
//$toto ='(((((1:0.01,2:0.01):0.05,(5:0.02,19:0 ... Voir la suite

Ces deux classes permettent d'envoyer un mail avec ou sans pièce jointe.

l'interface publique de la classe mail est :

1. public function __construct()
2. public function addAttachmentFromFile( $pathfile, $name )
3. public function addAttachmentFromString( $data, $mime, $filename )
4. public function addBCC($address)
5. public function addCC($address)
6. public function addFROM($address)
7. public function addSubject($x)
8. public function addTO($address)
9. public function addMessageHtml( $data , $fullHtmlDocument = false )
10. public function addMessageText( ... Voir la suite

• utilisez un autoloader de classe pour vous simplifier la vie
• j'utilise ça preque exclusivement en version statique, pour faire des sites spaghettis
• Debug::var_dump()
• Debug::here() si vous utilisez des output buffer (ob_start)
• Debug::printStack()
• Debug::describeState()
• c'est documenté pour phpdocumentor (enfin la partie la plus utile = statique )
• s'active et se desactive partout sans pb de visibilité avec Debug::$inhibit
• fonctionne dans le shell Debug::outputHTML

je suis pointilleux pour le coté GPL2. je répond au message par MP si vous trouvez un bug (dans la classe, pas dans votre code).

Cette classe permet d'afficher le code qui s'execute sur votre server.

Il y a deux modes de fonctionnement: soit en mode "coupure" (méthode 1) avec utilisation des fonction d'autoload et qui demande au code rendu d'être valable syntaxiquement et un mode "détaché" (methode 2) qui affiche/detecte n'importe quel code mais qui est plus délicat à utiliser et sécuriser...

Cette classe fonctionne de conserve avec la classe Debug que j'ai aussi publié (la classe débug produit un lien qui permet d'afficher le code à l'endroit de l'appel ) c'est pratique.

Par contre mal utilisé cette classe va permettre d'afficher des mots de passe dans le code ou des informations sensibles... a utiliser avec précaution.

ce script rassemble les informations nécessaire au débug de votre classe sur le forum... c'est loin d'être complet